По результатам опроса клубов ПФЛ определены лауреаты сезона 2006 года в первом дивизионе и в зонах второго дивизиона.
Лауреаты первого дивизиона:
Лучшим игрок — Андрей Тихонов («Химки»)
Лучший вратарь – Сергей Армишев («Урал»)
Лучший защитник – Александр Белозеров («КАМАЗ»)
Лучший полузащитник – Андрей Тихонов («Химки»)
Лучший нападающий – Евгений Алхимов («Урал»)
Лучший тренер – Александр Побегалов («Урал»)
Лауреаты второго дивизиона:
Зона «Юг»:
Лучший игрок – Сергей Дубровин («Спартак», Владикавказ)
Зона «Запад»:
Лучший игрок – Дмитрий Вязьмикин («Торпедо», Владимир)
Зона «Центр»:
Лучший игрок – Сергей Фаустов («Локомотив», Лиски)
Зона «Урал-Поволжье»:
Лучший игрок – Ильдар Низамутдинов («Носта», Новотроицк)
Зона «Восток»:
Лучший игрок – Владимир Левшин («Звезда», Иркутск)